硕士论文查重的原理主要是通过专业的查重软件对论文进行全文比对，检测文中是否存在与其他文献相似的部分。查重软件会将论文与数据库中的资料进行比对，标记出相似度较高的部分，帮助评估论文的原创性和学术诚信度。同时，查重原理还包括对文中文字、语法、逻辑等方面的检测，确保论文符合学术规范。

硕士论文查重的方法主要包括利用专业的查重软件进行检测，如Turnitin、万方查重等。学生在提交论文前可以自行使用查重软件进行预检测，及时发现可能存在的抄袭问题并进行修改。此外，指导老师和专业编辑也可以通过查重软件对学生论文进行查重，保障学术诚信。在撰写论文过程中，引用他人观点和资料时应注明出处，避免不当抄袭行为。